Mapping genomic loci implicates genes and synaptic biology in schizophrenia

Schizophrenia has a heritability of 60-80%(1), much of which is attributable to common risk alleles. Here, in a two-stage genome-wide association study of up to 76,755 individuals with schizophrenia and 243,649 control individuals, we report common variant associations at 287 distinct genomic loci....

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Bibliographic Details

Authors:	Trubetskoy V.; Pardiñas A.F.; Qi T.; Panagiotaropoulou G.; Awasthi S.; Bigdeli T.B.; Chen C.-Y.; Dennison C.A.; Hall L.S.; Lam M.; Watanabe K.; Frei O.; Ge T.; Harwood J.C.; Magnusson S.; Richards A.L.; Sidorenko J.; Wu Y.; Zeng J.; Grove J.; Kim M.; Li Z.; Voloudakis G.; Zhang W.; Adams M.; Agartz I.; Atkinson E.G.; Agerbo E.; Al Eissa M.; Albus M.; Alexander M.; Alizadeh B.Z.; Alptekin K.; Als T.D.; Amin F.; Arolt V.; Arrojo M.; Athanasiu L.; Azevedo M.H.; Bacanu S.A.; Bass N.J.; Begemann M.; Belliveau R.A.; Bene J.; Benyamin B.; Bergen S.E.; Blasi G.; Bobes J.; Bonassi S.; Braun A.; Bressan R.A.; Bromet E.J.; Bruggeman R.; Buckley P.F.; Buckner R.L.; Bybjerg-Grauholm J.; Cahn W.; Cairns M.J.; Calkins M.E.; Carr V.J.; Castle D.; Catts S.V.; Chambert K.D.; Chan R.C.K.; Chaumette B.; Cheng W.; Cheung E.F.C.; Chong S.A.; Cohen D.; Consoli A.; Cordeiro Q.; Costas J.; Curtis C.; Davidson M.; Davis K.L.; Degenhardt F.; DeLisi L.E.; Demontis D.; Dickerson F.; Dikeos D.; Dinan T.; Djurovic S.; Duan J.; Ducci G.; Dudbridge F.; Eriksson J.G.; Fañanás L.; Faraone S.V.; Fiorentino A.; Forstner A.; Frank J.; Freimer N.B.; Frustaci A.; Gadelha A.; Genovese G.; Gershon E.S.; Giannitelli M.; Giegling I.; Giusti-Rodríguez P.; Godard S.; Goldstein J.I.; González Peñas J.; González-Pinto A.; Gopal S.; Gratten J.; Green M.F.; Greenwood T.A.; Guillin O.; Gülöksüz S.; Gur R.E.; Gur R.C.; Gutiérrez B.; Hahn E.; Hakonarson H.; Haroutunian V.; Hartmann A.M.; Harvey C.; Hayward C.; Henskens F.A.; Herms S.; Hoffmann P.; Howrigan D.P.; Ikeda M.; Joa I.; Julià A.; Kähler A.K.; Kam-Thong T.; Kamatani Y.; Karachanak-Yankova S.; Kebir O.; Keller M.C.; Kelly B.J.; Khrunin A.; Kim S.-W.; Klovins J.; Kondratiev N.; Konte B.; Kraft J.; Kubo M.; Kucinskas V.; Kucinskiene Z.A.; Kusumawardhani A.; Kuzelova-Ptackova H.; Landi S.; Lazzeroni L.C.; Lee P.H.; Legge S.E.; Lehrer D.S.; Lencer R.; Lerer B.; Lieberman J.; Light G.A.; Limborska S.; Liu C.-M.; Lönnqvist J.; Loughland C.M.; Lubinski J.; Luykx J.J.; Lynham A.; Macek M.; Jr; Mackinnon A.; Magnusson P.K.E.; Maher B.S.; Maier W.; Malaspina D.; Mallet J.; Marder S.R.; Marsal S.; Martin A.R.; Martorell L.; Mattheisen M.; McCarley R.W.; McDonald C.; McGrath J.J.; Medeiros H.; Meier S.; Melegh B.; Melle I.; Mesholam-Gately R.I.; Metspalu A.; Michie P.T.; Milani L.; Milanova V.; Mitjans M.; Molden E.; Molina E.; Molto M.D.; Mondelli V.; Moreno C.; Morley C.P.; Muntané G.; Murphy K.C.; Myin-Germeys I.; Nenadic I.; Nestadt G.; Nikitina-Zake L.; Noto C.; Nuechterlein K.H.; O’Brien N.L.; O’Neill F.A.; Oh S.-Y.; Olincy A.; Ota V.K.; Pantelis C.; Papadimitriou G.N.; Parellada M.; Paunio T.; Pellegrino R.; Periyasamy S.; Perkins D.O.; Pfuhlmann B.; Pietiläinen O.; Pimm J.; Porteous D.; Powell J.F.; Quattrone D.; Quested D.; Radant A.D.; Rampino A.; Rapaport M.H.; Rautanen A.; Reichenberg A.; Roe C.; Roffman J.L.; Roth J.; Rothermundt M.; Rutten B.P.F.; Saker-Delye S.; Salomaa V.; Sanjuan J.; Santoro M.L.; Savitz A.; Schall U.; Scott R.J.; Seidman L.J.; Sharp S.I.; Shi J.; Siever L.J.; Sigurdsson E.; Sim K.; Skarabis N.; Slominsky P.; So H.-C.; Sobell J.L.; Söderman E.; Stain H.J.; Steen N.E.; Steixner-Kumar A.A.; Stögmann E.; Stone W.S.; Straub R.E.; Streit F.; Strengman E.; Stroup T.S.; Subramaniam M.; Sugar C.A.; Suvisaari J.; Svrakic D.M.; Swerdlow N.R.; Szatkiewicz J.P.; Ta T.M.T.; Takahashi A.; Terao C.; Thibaut F.; Toncheva D.; Tooney P.A.; Torretta S.; Tosato S.; Tura G.B.; Turetsky B.I.; Üçok A.; Vaaler A.; Veijola J.; Waddington J.; Walter H.; Waterreus A.; Webb B.T.; Weiser M.; Williams N.M.; Witt S.H.; Wormley B.K.; Wu J.Q.; Xu Z.; Yolken R.; Zai C.C.; Zhou W.; Zhu F.; Zimprich F.; Atbasoglu E.C.; Ayub M.; Benner C.; Bertolino A.; Black D.W.; Bray N.J.; Breen G.; Buccola N.G.; Byerley W.F.; Chen W.J.; Cloninger C.R.; Crespo-Facorro B.; Donohoe G.; Freedman R.; Galletly C.; Gandal M.J.; Gennarelli M.; Hougaard D.M.; Hwu H.-G.; Jablensky A.V.; McCarroll S.A.; Moran J.L.; Mors O.; Mortensen P.B.; Müller-Myhsok B.; Neil A.L.; Nordentoft M.; Pato M.T.; Petryshen T.L.; Pirinen M.; Pulver A.E.; Schulze T.G.; Silverman J.M.; Smoller J.W.; Stahl E.A.; Tsuang D.W.; Vilella E.; Wang S.-H.; Xu S.; Dai N.; Wenwen Q.; Agiananda F.; Amir N.; Antoni R.; Arsianti T.; Asmarahadi A.; Diatri H.; Djatmiko P.; Irmansyah I.; Khalimah S.; Kusumadewi I.; Kusumaningrum P.; Lukman P.R.; Nasrun M.W.; Safyuni N.S.; Prasetyawan P.; Semen G.; Siste K.; Tobing H.; Widiasih N.; Wiguna T.; Wulandari D.; Evalina N.; Hananto A.J.; Ismoyo J.H.; Marini T.M.; Henuhili S.; Reza M.; Yusnadewi S.; Abyzov A.; Akbarian S.; Ashley-Koch A.; van Bakel H.; Breen M.; Brown M.; Bryois J.; Carlyle B.; Charney A.; Coetzee G.; Crawford G.; Dracheva S.; Emani P.; Farnham P.; Fromer M.; Galeev T.; Gandal M.; Gerstein M.; Giase G.; Girdhar K.; Goes F.; Grennan K.; Gu M.; Guerra B.; Gursoy G.; Hoffman G.; Hyde T.; Jaffe A.; Jiang S.; Jiang Y.; Kefi A.; Kim Y.; Kitchen R.; Lay F.; Lee D.; Li M.; Liu C.; Liu S.; Mattei E.; Navarro F.; Pan X.; Peters M.A.; Pinto D.; Pochareddy S.; Polioudakis D.; Purcaro M.; Purcell S.; Pratt H.; Reddy T.; Rhie S.; Rozowsky J.; Sanders S.; Sestan N.; Sethi A.; Shi X.; Shieh A.; Swarup V.; Szekely A.; Wang D.; Warrell J.; Weissman S.; Weng Z.; White K.; Wiseman J.; Witt H.; Won H.; Wood S.; Wu F.; Xu X.; Yao L.; Zandi P.; Arranz M.J.; Bakker S.; Bender S.; Crepo-Facorro B.; Hall J.; Iyegbe C.; Kahn R.; Lawrie S.; Lewis C.; Lin K.; Linszen D.H.; Mata I.; Walshe M.; Weisbrod M.; Achsel T.; Andres-Alonso M.; Bagni C.; Bayés À.; Biederer T.; Brose N.; Brown T.C.; Chua J.J.E.; Coba M.P.; Cornelisse L.N.; de Jong A.P.H.; de Juan-Sanz J.; Dieterich D.C.; Feng G.; Goldschmidt H.L.; Gundelfinger E.D.; Hoogenraad C.; Huganir R.L.; Imig C.; Jahn R.; Jung H.; Kaeser P.S.; Kim E.; Koopmans F.; Kreutz M.R.; Lipstein N.; MacGillavry H.D.; Malenka R.; McPherson P.S.; O’Connor V.; Pielot R.; Ryan T.A.; Sahasrabudhe D.; Sala C.; Sheng M.; Smalla K.-H.; Smit A.B.; Südhof T.C.; Thomas P.D.; Toonen R.F.; van Weering J.R.T.; Verpelli C.; Adolfsson R.; Arango C.; Baune B.T.; Belangero S.I.; Børglum A.D.; Braff D.; Bramon E.; Buxbaum J.D.; Campion D.; Cervilla J.A.; Cichon S.; Collier D.A.; Corvin A.; Curtis D.; Forti M.D.; Domenici E.; Ehrenreich H.; Escott-Price V.; Esko T.; Fanous A.H.; Gawlik M.; Gejman P.V.; Gill M.; Glatt S.J.; Golimbet V.; Hong K.S.; Hultman C.M.; Hyman S.E.; Iwata N.; Jönsson E.G.; Kahn R.S.; Kennedy J.L.; Khusnutdinova E.; Kirov G.; Knowles J.A.; Krebs M.-O.; Laurent-Levinson C.; Lee J.; Lencz T.; Levinson D.F.; Li Q.S.; Liu J.; Malhotra A.K.; Malhotra D.; McIntosh A.; McQuillin A.; Menezes P.R.; Morgan V.A.; Morris D.W.; Mowry B.J.; Murray R.M.; Nimgaonkar V.; Nöthen M.M.; Ophoff R.A.; Paciga S.A.; Palotie A.; Pato C.N.; Qin S.; Rietschel M.; Riley B.P.; Rivera M.; Rujescu D.; Saka M.C.; Sanders A.R.; Schwab S.G.; Serretti A.; Sham P.C.; Stefánsson H.; Stefansson K.; Tsuang M.T.; Vawter M.P.; Weinberger D.R.; Werge T.; Wildenauer D.B.; Yu X.; Yue W.; Holmans P.A.; Pocklington A.J.; Roussos P.; Vassos E.; Verhage M.; Visscher P.M.; Yang J.; Posthuma D.; Andreassen O.A.; Kendler K.S.; Owen M.J.; Wray N.R.; Daly M.J.; Huang H.; Neale B.M.; Sullivan P.F.; Ripke S.; Walters J.T.R.; O’Donovan M.C.; de Haan L.; van Amelsvoort T.; van Winkel R.; Gareeva A.; Shi Y.; St Clair D.; van Os J.; PsychENCODE
Format:	Article
Status:	Published version
Publication date:	2022
Country:	España
Institution:	Institut d’Investigació Biomèdica Sant Pau (IIB Sant Pau)
Repository:	r-IIB SANT PAU. Repositorio Institucional de Producción Científica del Instituto de Investigación Biomédica Sant Pau
OAI Identifier:	oai:iibsantpau.fundanetsuite.com:p15352
Online Access:	https://iibsantpau.fundanetsuite.com/Publicaciones/ProdCientif/PublicacionFrw.aspx?id=15352 http://hdl.handle.net/10261/272315
Access Level:	Open access
Keyword:	allele biological processes cell differentiation genomics heritability Article BCL11B gene brain region CACNA1C gene cell differentiation central nervous system comorbidity developmental disorder disease association excitatory neuron FAM120A gene FOXP1 gene gene expression regulation gene identification gene locus gene mapping gene mutation gene set enrichment analysis gene structure genetic association genetic risk score genetic variability genome-wide association study GRIN2A gene human inhibitory neuron MYT1L gene nerve cell nervous system function neurologic disease neuropathology neurotransmission nonhuman ontology receptor gene regulator gene RERE gene schizophrenia single nucleotide polymorphism SLC39A8 gene SP4 gene synaptic membrane genetic predisposition genetics Alleles Genetic Predisposition to Disease Genome-Wide Association Study Genomics Humans Polymorph